ESmol -- molecular viewer

ESmol -- molecular viewer

biochem_fan
Jul 12, 2015
  • 191.7 KB

    Dateigröße

  • Android 1.6+

    Android OS

Über ESmol -- molecular viewer

Schneller molekularer Viewer, der Proteine, Nukleinsäuren und kleine Moleküle unterstützt.

ESmol - Molecular Viewer für Android

BEACHTEN!

Wenn Ihr Gerät NDKmol ausführen können, bitte verwenden. Es ist viel schneller und

haben mehr Funktionen als ESmol.

Sie können NDKmol von https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol bekommen.

ESmol wird für die Kompatibilität mit sehr alten Geräten beibehalten.

== == Über

ESmol ist ein Molekular Viewer für Android.

Sie können dreidimensionale Strukturen von Proteinen, Nukleinsäuren und kleinen Molekülen anzuzeigen. ESmol unterstützt die meisten gemeinsamen Darstellungen für Moleküle, wie band, Spur, Stick, Kugel und Linie. ESmol unterstützt auch die Symmetrieoperationen; biologische Baugruppen und Kristallpackung können angezeigt werden. Sie können Strukturen von RCSB PDB und NCBI PubChem suchen und herunterladen.

ESmol hat fast die gleiche Funktionalität wie GLmol, die in geschrieben

WebGL / Javascript und läuft auf Web-Browsern. Sie können versuchen, GLmol bei http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Merkmale ==

* Lesen Sie PDB-Datei

   (ESmol kann nicht große Moleküle öffnen (mehr als 3 MB). Zu diesem Zweck verwenden Sie bitte NDKmol bei http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)

* Read SDF / MOL-Datei

* Suchen und Herunterladen von Strukturen RCSB PDB und NCBI PubChem

* Drehen / Übersetzen / Zoom-Modells mit dem Finger

* Vertretungen

    - Linie

    - Halten

    - Kugel (van der Waals-Radius)

    - Alpha Kohlenstoff Spur

    - Ribbon

    - Strand

    - B Faktor Rohr

    - Nukleinsäure-Leiter

    - Nukleinsäure-Linie

    - Lösungsmittel 'Stars'

* Coloring

    - Durch die Kette

    - Durch die Sekundärstruktur (bei der in Blatt- / HELIX Datensätze definiert sind)

    - Durch die Elemente

    - Gradation (a.k.a chainbow)

    - B-Faktor

    - polar / unpolar

* Kristallographie

    - Anzeigeeinheitszelle

    - Anzeigen Kristallpackung (wenn in BEMERKUNG Abschnitt definiert)

    - Anzeige biologische Einheit (wenn in BEMERKUNG Abschnitt definiert)

== So verwenden ==

Beim Start lädt ESmol automatisch Deoxyhämoglobin (PDBID: 4HHB) als Beispiel. Sie können das Molekül durch den Finger drehen.

Zum Vergrößern oder das Molekül, drücken Sie die MENU-Taste auf Ihrem Telefon / Tablet und wählen Sie den Modus zu übersetzen. Zwei-Finger-Gesten werden ebenfalls unterstützt.

Um andere PDB-Dateien zu laden, die Datei in „PDB“ Verzeichnis der SD-Karte setzen und wählen Sie Befehl „Öffnen“ im Menü. Sie können auch Strukturen direkt aus RCSB PDB und NCBI PubChem Web-Server herunterladen. Wählen Sie „Suchen und Laden“ im Menü.

== == Kontakt

Projekt-Website wird auf http://webglmol.sourceforge.jp/ entfernt. Sie können auch Quellcodes erhalten.

Kommentare und Anregungen sind willkommen bei http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ oder [email protected]

=== Lizenzhinweis ===

ESmol selbst steht unter der GNU Lesser General Public License wie folgt.

Allerdings enthalten PDB-Dateien als Beispiele unter verschiedenen Bedingungen sind.

Bitte konsultiere

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

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ESmol - Molecular Viewer für Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Dieses Programm ist freie Software: es darf weitergegeben und / oder modifizieren

     es unter den Bedingungen der GNU Lesser General Public License wie veröffentlicht von

     die Free Software Foundation, entweder gemäß Version 3 der Lizenz oder

     (Nach Ihrer Wahl) jede spätere Version.

     Dieses Programm wird in der Hoffnung, dass es nützlich sein wird,

     aber OHNE JEGLICHE GARANTIE; sogar ohne die implizite Garantie der

     Marktfähigkeit oder Eignung für einen bestimmten Zweck. siehe

     GNU Lesser General Public License für weitere Details.

     Sie sollten eine Kopie der GNU Lesser General Public License erhalten

     zusammen mit diesem Programm. Wenn nicht, finden Sie unter .

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Last updated on 2015-07-13
Version 0.74 (20121103)

* Fixed "Search PDB" to work with recent server update

Version 0.72 (20120120)

As fog causes a coloring problem on certain devices such as Samsung's Galaxy series, I decided to disable fog by default. You can turn it on from "Preference" menu.
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Videos und Screenshots

  • ESmol -- molecular viewer Plakat
  • ESmol -- molecular viewer Screenshot 1
  • ESmol -- molecular viewer Screenshot 2

ESmol -- molecular viewer APK -Informationen

Letzte Version
0.74
Kategorie
Lernen
Android OS
Android 1.6+
Dateigröße
191.7 KB
Entwickler
biochem_fan
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