Trzymająca w napięciu opowieść o licealistach, którzy ścigają tajemnicze zjawiska krążące wokół szkolnej sali gimnastycznej.
„Cień czai się w budynku szkoły” to historia licealistów Tomoyi i Kyoko, którzy podejmują wyzwanie tajemniczego zjawiska, które ma miejsce w ich szkole nocą, spowitą ciszą. Badają przyczynę niesamowitych głosów dochodzących z sali gimnastycznej i ostatecznie odkrywają głęboką tajemnicę, która rozprzestrzenia się w szkole. To zadanie prowadzi do podejrzanego ostrzeżenia ze strony nauczyciela gimnastyki, dziwnych zeznań woźnego i tajemnicy przeniesionego ucznia, a także naraża szkołę na długo skrywane tajemnice. Fabuła przedstawia trzymający w napięciu rozwój sytuacji, w którym uczniowie odkrywają prawdę o tajemniczym zjawisku w sali gimnastycznej i zbliżają się do tożsamości cienia czającego się w budynku szkoły. Dzięki swoim przygodom czytelnicy zostają wciągnięci w świat cudów i grozy.