NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Molecular Viewer para Android

Acerca == ==

NDKmol es un visor molecular para Android. Puede ver estructuras tridimensionales de proteínas, ácidos nucleicos y moléculas pequeñas. NDKmol compatible con la mayoría de las representaciones comunes para las moléculas, como la cinta, rastro, palo, esfera y la línea. NDKmol también apoya operaciones de simetría; ensamblajes biológicos y el embalaje cristalino se pueden mostrar. Usted puede buscar y descargar estructuras de RCSB PDB y NCBI PubChem.

NDKmol tiene casi la misma funcionalidad como GLmol, que está escrito en

WebGL / Javascript y se ejecuta en los navegadores Web. Usted puede tratar de GLmol en http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Características ==

* Archivo SDF / MOL Leer PDB o

* Rotar / Trasladar / modelo de zoom con el dedo

* Representaciones

    - Línea

    - Pegar

    - Esfera (van der Waals radio)

    - Alfa huella de carbono

    - Cinta (fino o grueso)

    - Strand

    - Tubo de factor B

    - Escalera de ácido nucleico

    - La línea de ácido nucleico

    - Solventes 'estrellas'

* Alisamiento de las hojas beta

* Colorear

    - Por la cadena

    - Por la estructura secundaria (cuando se define en los registros HOJA / HELIX)

    - Por Elementos

    - Gradación (a.k.a chainbow)

    - Factor B

    - Polar / no polar

* Cristalografía

    - Celda unidad Display

    - Mostrar cristal de embalaje (cuando se define en la sección OBSERVACIONES)

    - Mostrar asamblea biológica (cuando se define en la sección OBSERVACIONES)

== Cómo utilizar ==

Cuando se inicia, NDKmol carga automáticamente Porin (PDBID: 2POR) como ejemplo. Puede girar la molécula por el dedo.

Para ampliar o traducir la molécula, pulse el botón MENU en el teléfono / tablet y seleccione el modo. También se admiten los gestos de dos dedos.

Todo lo demás se puede hacer en el menú.

Para cargar otros archivos PDB, por favor, poner el archivo en el directorio "APP" de la tarjeta SD y seleccione el comando "Abrir" en el menú. También puede descargar directamente de estructuras RCSB AP y el servidor web NCBI PubChem. Seleccione "Search and Download" en el menú.

Contacto == ==

Página web del proyecto se encuentra en http://webglmol.sourceforge.jp/. Usted puede obtener los códigos fuente para este programa desde aquí.

Comentarios y sugerencias son bienvenidos en http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ o biochem_fan@users.sourceforge.jp

=== Aviso LICENCIA ===

Sí NDKmol está licenciado bajo GNU Licencia Pública General Reducida de la siguiente manera.

Sin embargo, los archivos de AP incluyen como ejemplos están en condiciones diferentes.

Por favor consulte

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

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