Больница Святого Антония Джопу была основана епископом Mgr. Антониус Тайзен
Rumah Sakit Santo Antonius Jopu didirikan oleh Uskup Agung Ende, Mgr. Antonius Theisen pada tahun 1961. Pada awal berdirinya, rumah sakit ini merupakan Balai Pengobatan dan Balai Kesehatan Ibu dan Anak (BP/BKIA) dengan kapasitas 45 tempat tidur. Rumah sakit santo Antonius Jopu berlokasi di desa Jopu, kecamatan Wolowaru, kabupaten Ende, provinsi Nusa Tenggara Timur. Rumah sakit ini dirintis oleh Yayasan Kesehatan Santo Lukas Ende dan dikelola oleh para Suster Tarekat CIJ (Congregatio Imitation Jesu) dengan tujuan melayani umat / masyarakat dipelosok Keuskupan Agung Ende dibawah pengawasan Dokter Puskesmas Wolowaru. Seiring dengan berjalannya waktu dan meningkatnya kebutuhan pelayanan kesehatan masyarakat, Keuskupan Agung Ende mendatangkan seorang dokter yaitu dr. Paulus The (The Gwan Tjaij) pada tanggal 1 September 1967. Sejak tanggal 1 September 1967 sampai dengan tahun 1970 dr. Paulus The berjuang untuk meningkatkan Status BP/BKIA menjadi Rumah Sakit dengan membentuk Organisasi Biro Medis bersama Vikjen Keuskupan Agung Ende.