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健康檢查的目的，在於「早期發現疾病、早期治療」，並強調「預防勝於治療」的觀念。糖尿病、高血壓、心臟病，這些都是慢性的疾病，藉由健康檢查的篩檢，這些疾病都可以檢查出來，從而得到適當的治療。

癌症，近年來已高居國人十大死因的首位，大家談癌色變，其實癌症並不可怕，如能早期診斷早期治療，其預後也是很好，像子宮頸零期癌、早期胃癌，手術治療以後，其存活率皆相當高。

疾病發生時，並不一定有臨床症狀，像早期胃癌，它可以完全沒有症狀，但可由健康檢查胃鏡而篩檢出；晚期胃癌的症狀有如貧血、體重減輕、食慾不振，有這些症狀時，疾病已經到了晚期，其預後就比早期差很多。

B型肝炎及C型肝炎在台灣相當普遍，其與肝硬化、肝癌有顯著的關係，可經由定期檢查胎兒蛋白及腹部超音波，將早期的小肝癌篩檢出，經由手術或栓塞的治療，其預後也比肝癌末期好很好。