NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Viewer moléculaire pour Android

== Propos ==

NDKmol est un visualiseur moléculaire pour Android. Vous pouvez visualiser des structures tridimensionnelles des protéines, des acides nucléiques et de petites molécules. NDKmol supporte la plupart des représentations communes des molécules, telles que rubans, trace, bâton, sphère et de la ligne. NDKmol prend également en charge les opérations de symétrie; ensembles biologiques et de l'emballage en cristal peuvent être affichés. Vous pouvez rechercher et télécharger des structures de RCSB APB et NCBI PubChem.

NDKmol a presque les mêmes fonctionnalités que GLmol, qui est écrit en

WebGL / Javascript et fonctionne sur les navigateurs Web. Vous pouvez essayer GLmol à http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

Caractéristiques == ==

* SDF / MOL fichier en lecture ou APB

* Tournez / Traduire / Zoom modèle par le doigt

* Représentations

    - Ligne

    - S'en tenir

    - Sphère (van der Waals)

    - Alpha carbone trace

    - Ribbon (fin ou épais)

    - Strand

    - Tube de facteur B

    - Echelle d'acides nucléiques

    - Ligne de l'acide nucléique

    - Solvants «stars»

* Lissage des bêta-feuilles

* Coloriage

    - Par chaîne

    - Par structure secondaire (lorsque défini dans les documents de format / hélice)

    - Par des éléments

    - Dégradé (a.k.a chainbow)

    - Facteur B

    - Polaire / non polaire

* Cristallographie

    - Cellule d'unité d'affichage

    - Emballage d'exposition de cristal (lorsqu'elle est définie dans la section REMARQUE)

    - Afficher assemblage biologique (lorsqu'elle est définie dans la section REMARQUE)

== Comment utiliser ==

Lors de son lancement, NDKmol charge automatiquement Porin (PDBID: 2POR) comme un exemple. Vous pouvez faire pivoter la molécule par votre doigt.

Pour agrandir ou de traduire la molécule, appuyez sur le bouton de menu de votre téléphone / tablette et sélectionner le mode. Gestes à deux doigts sont également supportés.

Tout le reste peut être effectué depuis le menu.

Pour charger d'autres fichiers PDB, s'il vous plaît placer le fichier dans le répertoire "APB" de la carte SD et sélectionnez la commande "Ouvrir" dans le menu. Vous pouvez également télécharger directement à partir de structures RCSB APB et le serveur web NCBI PubChem. Sélectionnez "Search and Download" dans le menu.

Contactez == ==

Site web du projet est situé à http://webglmol.sourceforge.jp/. Vous pouvez obtenir le code source de ce programme d'ici.

Commentaires et suggestions sont les bienvenues à http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ou [email protected]

=== Mention de la licence ===

NDKmol lui-même est sous licence GNU Lesser General Public License comme suit.

Cependant, les fichiers PDB inclus comme exemples dans différentes conditions.

S'il vous plaît consulter

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

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     COMMERCIALISATION ou D'ADAPTATION À UN USAGE PARTICULIER. Voir l'

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     Vous devriez avoir reçu une copie de la GNU Lesser General Public License GNU

     avec ce programme. Sinon, voir .