NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Viewer Molekuler untuk Android

Tentang == ==

NDKmol adalah penampil molekuler untuk Android. Anda dapat melihat struktur tiga dimensi protein, asam nukleat dan molekul kecil. NDKmol mendukung sebagian besar representasi umum untuk molekul, seperti pita, jejak, tongkat, bola dan garis. NDKmol juga mendukung operasi simetri, majelis biologis dan kemasan kristal dapat ditampilkan. Anda dapat mencari dan men-download dari struktur RCSB PDB dan NCBI PubChem.

NDKmol memiliki hampir fungsi yang sama dengan GLmol, yang ditulis dalam

WebGL / Javascript dan berjalan pada Web browser. Anda dapat mencoba GLmol di http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Fitur ==

* Baca PDB atau SDF / MOL berkas

* Putar / Terjemahkan / Zoom Model oleh jari

* Representasi

    - Jalur

    - Tongkat

    - Sphere (van der Waals radius)

    - Alpha karbon jejak

    - Pita (Tipis atau Tebal)

    - Strand

    - B Faktor tube

    - Tangga Asam nukleat

    - Garis Asam nukleat

    - Pelarut 'bintang'

* Smoothing beta-sheet

* Mewarnai

    - Dengan rantai

    - Dengan struktur sekunder (bila didefinisikan dalam LEMBAR / HELIX catatan)

    - Dengan Elemen

    - Gradasi (a.k.a chainbow)

    - Faktor B

    - Polar / nonpolar

* Kristalografi

    - Tampilan sel satuan

    - Tampilkan kemasan kristal (bila didefinisikan dalam bagian KETERANGAN)

    - Tampilan perakitan biologis (bila didefinisikan dalam bagian KETERANGAN)

== Cara Menggunakan ==

Saat diluncurkan, NDKmol otomatis beban Porin (PDBID: 2POR) sebagai contoh. Anda dapat memutar molekul dengan jari Anda.

Untuk memperbesar atau menerjemahkan molekul, tekan tombol MENU di telepon / tablet dan memilih mode. Gerakan dua jari juga didukung.

Segala sesuatu yang lain dapat dilakukan dari MENU.

Untuk memuat file PDB lainnya, silakan memasukkan file dalam "PDB" direktori kartu SD dan pilih "Open" perintah MENU. Anda juga dapat men-download langsung dari struktur RCSB PDB dan NCBI PubChem server web. Pilih "Search and download" pada menu.

Hubungi == ==

Situs proyek terletak di http://webglmol.sourceforge.jp/. Anda bisa mendapatkan kode sumber untuk program ini dari sini.

Komentar dan saran dipersilahkan di http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ atau [email protected]

=== Pemberitahuan LISENSI ===

NDKmol sendiri dilisensikan di bawah GNU Lesser General Public License sebagai berikut.

Namun, file PDB dimasukkan sebagai contoh adalah dalam kondisi BERBEDA.

Silakan berkonsultasi

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

-------------

NDKmol - Viewer Molekuler untuk Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Program ini adalah perangkat lunak bebas: Anda dapat menyebarluaskannya dan / atau memodifikasi

     di bawah GNU Lesser General Public License sebagaimana dipublikasikan oleh

     Free Software Foundation, baik versi 3 dari Lisensi, atau

     (Dengan pilihan Anda) versi yang lebih baru.

     Program ini didistribusikan dengan harapan bahwa itu akan berguna,

     tetapi TANPA GARANSI; bahkan tanpa jaminan tersirat

     PENJUALAN atau KESESUAIAN UNTUK TUJUAN TERTENTU. Lihat

     GNU Lesser General Public License untuk rincian lebih lanjut.

     Anda seharusnya menerima salinan dari GNU Lesser General Public License

     bersama dengan program ini. Jika tidak, lihat .