NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Молекулярная просмотра для Android

О == ==

NDKmol представляет собой молекулярный просмотра для Android. Можно просматривать трехмерные структуры белков, нуклеиновых кислот и малых молекул. NDKmol поддерживает большинство общих представлений для молекулы, такие как ленты, след, палка, сферы и линии. NDKmol также поддерживает операции симметрии, биологические узлов и кристаллической упаковки может быть отображен. Вы можете найти и скачать структур из RCSB PDB и NCBI PubChem.

NDKmol имеет почти такую ​​же функциональность как GLmol, которая написана на

WebGL / JavaScript и работает на веб-браузеров. Вы можете попробовать GLmol на http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Возможности ==

* Прочитанными PDB или SDF / моль файл

* Поворот / Translate / Увеличить модель пальца

* Представительства

    - Line

    - Придерживайтесь

    - Сфера (ван-дер-радиус)

    - Alpha углерода след

    - Лента (тонкие или толстые)

    - Strand

    - B фактором трубки

    - Нуклеиновые кислоты лестнице

    - Нуклеиновые кислоты линии

    - Растворитель "звезд"

* Сглаживание бета-листы

* Раскраски

    - По цепочке

    - Вторичная структура (если она определена в лист / HELIX записей)

    - По элементам

    - Градация (a.k.a chainbow)

    - B фактора

    - Полярные / неполярные

* Кристаллографии

    - Отображение ячейки

    - Показать кристаллической упаковки (если она определена в замечании раздел)

    - Отображение биологической сборки (если она определена в замечании раздел)

== Как использовать ==

При запуске автоматически загружает NDKmol Порин (PDBID: 2POR) в качестве примера. Вы можете вращать молекулу пальцем.

Для увеличения или перевод молекулы, нажмите кнопку меню в телефон / планшет и выбрать режим. Двумя пальцами жесты, также поддерживаются.

Все остальное можно сделать из меню.

Чтобы загрузить другие PDB файлах, пожалуйста, поместите файл в "PDB" директорию карты SD и выберите команду "Открыть" в меню. Вы также можете скачать непосредственно из структур RCSB PDB и NCBI PubChem веб-сервер. Выберите "поиска и загрузки" в меню.

Связаться == ==

Веб-сайт проекта находится по адресу http://webglmol.sourceforge.jp/. Вы можете получить исходный код для этой программы отсюда.

Комментарии и предложения присылайте на http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ или [email protected]

Лицензионное соглашение === ===

NDKmol себя под лицензией GNU Lesser Лицензия широкой публики в следующем.

Однако, PDB файлы, включенные в качестве примеров в различных условиях.

Пожалуйста, обратитесь

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

-------------

NDKmol - Молекулярная просмотра для Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Данная программа является свободным программным обеспечением: вы можете распространять и / или изменять

     его в соответствии с условиями GNU Lesser General Public License, опубликованной

     Фонд свободного программного обеспечения, либо версии 3 лицензии, либо

     (По вашему выбору) любой более поздней версии.

     Эта программа распространяется в надежде, что она будет полезной,

     но БЕЗ ВСЯКИХ ГАРАНТИЙ, даже без подразумеваемых гарантий

     Или ПРИГОДНОСТИ ДЛЯ КОНКРЕТНЫХ ЦЕЛЕЙ. Смотреть

     GNU Lesser General Public License для более подробной информации.

     Вы должны были получить копию лицензии GNU для широкой публики

     вместе с этой программой. Если нет, см. .