NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Viewer Molekul untuk Android

Mengenai == ==

NDKmol adalah penonton molekul untuk Android. Anda boleh melihat tiga struktur dimensi protein, asid nukleik dan molekul kecil. NDKmol menyokong kebanyakan perwakilan biasa untuk molekul, seperti riben, kesan, kayu, sfera dan talian. NDKmol juga menyokong operasi simetri; perhimpunan biologi dan pembungkusan kristal boleh dipaparkan. Anda boleh mencari dan memuat turun struktur daripada RCSB PDB dan NCBI PubChem.

NDKmol mempunyai hampir fungsi sama seperti GLmol, yang ditulis dalam

WebGL / Javascript dan berjalan pada pelayar web. Anda boleh cuba GLmol di http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

Ciri-ciri == ==

* Read PDB atau SDF / MOL fail

* Putar / Terjemah / model Zoom oleh jari

* Perwakilan

    - Talian

    - Stick

    - Sphere (van der Waals radius)

    - Alpha karbon jejak

    - Ribbon (nipis atau tebal)

    - Strand

    - B tiub faktor

    - Tangga asid nukleik

    - Line asid nukleik

    - Pelarut 'bintang'

* Smoothing beta-kira

* Mewarnai

    - By rantaian

    - By struktur sekunder (apabila ditakrifkan dalam rekod SHEET / HELIX)

    - By Elements

    - Penggredan (a.k.a chainbow)

    - Faktor B

    - Kutub / nonpolar

* Kristalografi

    - Paparan unit sel

    - Show kristal pembungkusan (apabila ditakrifkan dalam seksyen NOTA)

    - Paparkan pemasangan biologi (apabila ditakrifkan dalam seksyen NOTA)

== Bagaimana untuk Menggunakan ==

Apabila dilancarkan, NDKmol secara automatik memuatkan Porin (PDBID: 2POR) sebagai contoh. Anda boleh berputar molekul dengan jari anda.

Untuk mengezum atau menterjemahkan molekul, tekan butang MENU di dalam telefon / tablet anda dan pilih mod. Isyarat dua jari juga disokong.

Segala-galanya boleh dilakukan dari MENU.

Untuk memuatkan fail PDB yang lain, sila meletakkan fail dalam "PDB" direktori kad SD dan pilih "Open" perintah dalam MENU. Anda juga boleh memuat turun secara langsung daripada struktur RCSB PDB dan NCBI PubChem web server. Pilih "Cari dan turun" dalam menu.

Hubungi == ==

Laman web projek terletak di http://webglmol.sourceforge.jp/. Anda boleh mendapatkan kod sumber bagi program ini dari sini.

Komen dan cadangan adalah dialu-alukan di http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ atau [email protected]

=== Notis LESEN ===

NDKmol sendiri dilesenkan di bawah GNU General Public License seperti berikut.

Walau bagaimanapun, fail PDB dimasukkan sebagai contoh adalah di bawah keadaan yang berbeza.

Sila rujuk

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

-------------

NDKmol - Viewer Molekul untuk Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Program ini adalah perisian percuma: anda boleh mengedarkannya semula dan / atau mengubah

     di bawah syarat-syarat GNU Lesser General Public License seperti yang diterbitkan oleh

     Yayasan Perisian Bebas, sama ada versi 3 Lesen, atau

     (Mengikut pilihan anda) mana-mana versi selepas ini.

     Program ini diedarkan dengan harapan bahawa ia akan menjadi berguna,

     tetapi TANPA SEBARANG WARANTI; tanpa jaminan yang tersirat

     KEBOLEHDAGANGAN atau KESESUAIAN UNTUK TUJUAN TERTENTU. Lihat

     GNU Lesser General Public License untuk maklumat lanjut.

     Anda harus telah menerima satu salinan GNU Lesser General Public License

     bersama-sama dengan program ini. Jika tidak, melihat .