NDKmol - molecular viewer

NDKmol - xem phân tử cho Android

== Giới thiệu ==

NDKmol là một người xem phân tử cho Android. Bạn có thể xem cấu trúc ba chiều của protein, axit nucleic và các phân tử nhỏ. NDKmol hỗ trợ hầu hết các đại diện chung cho các phân tử, chẳng hạn như băng, dấu vết, thanh, hình cầu và đường. NDKmol cũng hỗ trợ các hoạt động đối xứng; hội sinh học và đóng gói tinh thể có thể được hiển thị. Bạn có thể tìm kiếm và tải về các cấu trúc từ RCSB PDB và NCBI PubChem.

NDKmol có gần như cùng các chức năng như GLmol, được viết trong

WebGL / Javascript và chạy trên trình duyệt web. Bạn có thể thử GLmol tại http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Tính năng ==

* Đọc PDB hoặc SDF / MOL tập tin

* Xoay / Dịch / Zoom mô hình bằng ngón tay

* Đại diện

    - Line

    - Stick

    - Sphere (van der Waals bán kính)

    - Alpha carbon dấu vết

    - Ribbon (mỏng hay dày)

    - Strand

    - Ống yếu tố B

    - Thang Axit nucleic

    - Dòng Axit nucleic

    - Dung môi 'sao'

* Làm mịn của beta-tờ

* Màu

    - Đến chuỗi

    - Theo cấu trúc thứ cấp (khi xác định trong KẾ TOÁN / HELIX hồ sơ)

    - Elements

    - Cấp độ xám (a.k.a chainbow)

    - Yếu tố B

    - Cực / không phân cực

* Tinh thể học

    - Tế bào đơn vị hiển thị

    - Hiển thị đóng gói tinh thể (khi được xác định trong phần MẠC)

    - Hiển thị lắp ráp sinh học (khi được xác định trong phần MẠC)

== Làm thế nào để sử dụng ==

Khi ra mắt, NDKmol tự động tải Porin (PDBID: 2POR) là một ví dụ. Bạn có thể xoay các phân tử bằng ngón tay của bạn.

Để phóng to hoặc dịch các phân tử, nhấn nút MENU trong điện thoại / máy tính bảng của bạn và chọn chế độ. Cử chỉ hai ngón tay cũng được hỗ trợ.

Tất cả mọi thứ khác có thể được thực hiện từ MENU.

Để tải các tập tin PDB khác, xin vui lòng đặt các tập tin trong "PDB" thư mục của thẻ SD và chọn "Open" lệnh trong MENU. Bạn cũng có thể tải về trực tiếp từ cấu trúc RCSB PDB và NCBI máy chủ web PubChem. Chọn "Tìm kiếm và Download" trong menu.

== Liên ==

Trang web của dự án nằm tại http://webglmol.sourceforge.jp/. Bạn có thể nhận được mã nguồn cho chương trình này từ đây.

Ý kiến ​​đóng góp đều được chào đón tại http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ hoặc [email protected]

=== Thông báo PHÉP ===

NDKmol chính được cấp phép theo GNU Lesser General Public License như sau.

Tuy nhiên, các tập tin PDB bao gồm như là ví dụ là trong điều kiện KHÁC.

Xin vui lòng tham khảo ý kiến

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

-------------

NDKmol - xem phân tử cho Android

     (C) Bản quyền 2011, biochem_fan

     Chương trình này là phần mềm tự do: bạn có thể phát hành lại nó và / hoặc sửa đổi

     theo các điều khoản của GNU Public License bởi

     Phần mềm Tự do, một trong hai phiên bản 3 của Giấy phép, hoặc

     (Tùy chọn) bất kỳ phiên bản sau.

     Chương trình này được phân phối với hy vọng rằng nó sẽ hữu ích,

     nhưng KHÔNG CÓ BẢO HÀNH không bảo đảm ngụ ý khả năng

     BÁN hoặc PHÙ HỢP CHO MỘT MỤC ĐÍCH CỤ THỂ. Xem

     Ít hơn GNU Public License để biết thêm chi tiết.

     Bạn sẽ nhận được một bản sao của Giấy phép Công cộng Ít hơn GNU

     cùng với chương trình này. Nếu không, xem .