Juicebox VR

Jelajahi Hi-C 3D Data sekuensing genom dalam lingkungan virtual reality!

Juicebox VR menciptakan representasi virtual reality data yang dihasilkan oleh metode Hi-C untuk tiga dimensi sekuensing genom. Setiap posisi 2D dalam lanskap sesuai dengan sepasang posisi 1D, atau lokus, dalam genom manusia tiga miliar huruf-panjang. Tinggi pada posisi 2D mewakili seberapa sering kedua lokus berada dalam kontak di dalam inti sel.

Karena lokus terdekat sering bertemu satu sama lain, 'dinding' besar jarak pendek kontak membagi lanskap. Dataran tinggi persegi datang dari berkorespondensi diagonal ke domain genom kental, yang disebut domain kontak. Puncak dalam lanskap sesuai dengan loop dalam genom. Domain kontak sering dibatasi oleh loop, itulah sebabnya mengapa domain persegi sering memiliki puncak di sudut mereka.

Controller akan terbang ke arah mana Anda melihat. Melihat ke atas untuk melompat super.

Juicebox VR diciptakan oleh Muhammad Shamim, Ido Machol, dan Erez Lieberman Aiden.

Data tersebut diambil dari:

Suhas Rao *, Miriam Huntley *, Neva C. Durand, Elena Stamenova, Ivan Bochkov Bahasa, Jim Robinson, Adrian Sanborn, Ido Machol, Arina Omer, Eric Lander dan Erez Lieberman Aiden. Sebuah 3D Map of the Human Genome di Resolusi kilobase Mengungkapkan Prinsip kromatin Looping, Sel (2014).

* Kontribusi sama

Perhatikan bahwa data yang digunakan untuk menghasilkan lanskap merupakan daerah yang sangat kecil dari penuh, genome-wide peta. Peta kontak penuh untuk genom manusia adalah satu triliun kali lebih besar dari peta ini.

Pelajari lebih lanjut tentang pekerjaan kami di www.aidenlab.org.

Musik: Pendakian oleh Stellardrone

PENTING: Untuk benar melihat aplikasi, sebuah Reality Virtual headset, seperti Google Karton, Durovis Dive, atau Samsung Aksesoris VR harus digunakan.