Juicebox VR

Исследуйте Привет-C 3D-данные секвенирования генома в виртуальной среде реальность!

Juicebox VR создает виртуальное представление реальности данных, полученных с помощью метода Привет-C для трехмерного секвенирования генома. Каждый 2D положение в ландшафте соответствует паре 1D позиций или локусы, в три миллиарда букв длиной генома человека. Высота в 2D положение представляет, как часто два локуса находятся в контакте в ядре клетки.

С рядом локусов часто врезаться в друг друга, массивная "стеной" контактов малой дальности делит ландшафт. Квадратные плато сходит диагональный, соответствуют конденсированных геномных доменов, называемых контактных областей. Пики в ландшафте соответствуют петлям в геноме. Связаться с доменов часто разграничиваются петель, поэтому квадратные домены часто имеют пики в своем углу.

Контроллер будет летать в любом направлении вы смотрите. Смотрите прямо на супер прыжок.

Juicebox VR была создана Мухаммадом Шамин, идо Machol и Эрез Либерман Aiden.

Данные получены из:

Suhas Рао *, Мириам Хантли * Нева С. Дюран, Елена Stamenova, Иван Бочков, Джим Робинсон, Адриан Sanborn, идо Machol, Арина Омер, Эрик Ландер и Эрез Либерман Эйден. 3D-карта генома человека кб Разрешение показывает принципы хроматина цикл, Cell (2014).

* Способствовали в равной степени

Обратите внимание, что данные, используемые для генерации ландшафта очень маленькая область с полной, генома карте. Полная контактная карта генома человека в триллион раз больше, чем этой карте.

Узнайте больше о нашей работе в www.aidenlab.org.

Музыка: Подъем по Stellardrone

ВАЖНО: Для нормального просмотра приложение, Virtual Reality гарнитура, таких как Google Картон, Durovis дайвингом или Samsung передач VR должен быть использован.