Juicebox VR

Sanal gerçeklik ortamında Hi-C 3D genom dizileme verileri keşfedin!

Juicebox VR üç boyutlu genom sekanslama için Hi-C yöntemi ile oluşturulan verilerin bir sanal gerçeklik temsil oluşturur. Manzara her 2D pozisyon üç milyar harf uzunluğunda insan genomunda, 1D pozisyonları, ya loci bir çift gelir. 2B konumunda yüksekliği iki lokus bir hücrenin çekirdeğinde temas ne sıklıkta temsil eder.

Yakındaki loci sık sık birbirlerine çarparlar beri, kısa menzilli kişileri büyük bir 'duvar' manzara ikiye bölmektedir. Kare yaylalar yoğunlaştırılmış genomik etki denilen kişi etki diyagonal uyumluluğunu kapalı geliyor. Peyzaj Peaks genom döngüler karşılık gelmektedir. İletişim alanlar genellikle kare alanları sık sık köşesinde zirveleri neden olduğu, döngüler ile ayrılır.

kontrolör bakmak hangisi yönde uçacak. Düz bir süper atlama için bak.

Juicebox VR Muhammed Shamim, Ido Machol ve Erez Lieberman Aiden tarafından oluşturuldu.

veri çekilir:

Suhas Rao *, Miriam Huntley *, Neva C. Durand, Elena Stamenova, Ivan Bochkov, Jim Robinson, Adrian Sanborn, Ido Machol, Arina Ömer, Eric Lander ve Erez Lieberman Aiden. Kilobaz Çözünürlük İnsan genomunun bir 3D Harita Kromatin Loop, Cell (2014) İlkeleri ortaya çıkarır.

* Eşit katkıda

Peyzaj oluşturmak için kullanılan veriler tam, genom haritadan son derece küçük bölge olduğunu unutmayın. İnsan genomu için tam temas haritası bu harita daha trilyon kat daha büyüktür.

Www.aidenlab.org bizim çalışmaları hakkında daha fazla bilgi edinin.

Müzik: Stellardrone tarafından Ascent

ÖNEMLİ: düzgün app görüntülemek için, örneğin Google Karton, Durovis Dive, veya Samsung Dişli VR gibi bir Sanal Gerçeklik kulaklık kullanılmalıdır.