Juicebox VR

Przeglądaj Hi-C sekwencjonowania genomu danych 3D w środowisku wirtualnej rzeczywistości!

Juicebox VR tworzy wirtualną reprezentację rzeczywistości danych uzyskanych metodą Hi-C dla trójwymiarowej sekwencjonowania genomu. Każde położenie 2D w krajobrazie odpowiada parze pozycji 1D lub loci w trzech miliardów litery długości ludzkiego genomu. Wysokość w miejscu 2D oznacza, jak często te dwa loci są w kontakcie w jądrze komórki.

Ponieważ w pobliżu loci częściej wpadać na siebie ogromny "ściana" kontaktów krótkiego zasięgu przecina krajobraz. Kwadratowych płaskowyże spadając przekątnej odpowiadają skróconego genomu domen, zwanych domenami kontaktowych. Szczyty w krajobrazie odpowiadają pętli w genomie. Domeny kontaktowe są często ograniczony przez pętle, dlatego domeny kwadratowych często mają szczyty w swoim kącie.

Kontroler będzie latać z każdego kierunku, wyglądasz. Spójrz prosto na super skoku.

Juicebox VR został stworzony przez Muhammada Shamim, Ido Machol Erez Lieberman i Aiden.

Dane pochodzą z:

Suhas Rao * Miriam Huntley *, Neva C. Durand, Elena Stamenova Ivan Bochkov, Jim Robinson, Adrian Sanborn, Ido Machol, Arina Omer, Eric Lander Erez Lieberman Aiden i. 3D mapa genomu ludzkiego w Kilobase Rozdzielczość ujawnia Zasady chromatyny pętli, komórki (2014 r).

* Przyczyniły się również

Należy pamiętać, że dane wykorzystane do wygenerowania krajobraz jest bardzo mały obwód z pełnej, genomu mapie. Pełna mapa serwisu kontakt dla ludzkiego genomu jest trylion razy większe niż tej mapie.

Dowiedz się więcej o naszej pracy w www.aidenlab.org.

Muzyka: Ascent przez Stellardrone

WAŻNE: Aby prawidłowo korzystać z aplikacji, Wirtualny zestaw słuchawkowy Reality, takich jak Google, Tektura, Durovis Dive, lub Samsung Bieg VR powinien być stosowany.