Juicebox VR

สำรวจ Hi-C ข้อมูลลำดับจีโนม 3D ในสภาพแวดล้อมเสมือนจริง!

Juicebox VR สร้างตัวแทนเสมือนจริงของข้อมูลที่สร้างโดยวิธี Hi-C เป็นลำดับจีโนมสามมิติ ทุกตำแหน่ง 2D ในภูมิทัศน์ที่สอดคล้องกับคู่ของตำแหน่ง 1D หรือ loci ในสามพันล้านตัวอักษรยาวจีโนมมนุษย์ ความสูงที่ตำแหน่ง 2D แสดงให้เห็นถึงวิธีการที่มัก loci สองอยู่ในการติดต่อในนิวเคลียสของเซลล์

ตั้งแต่ loci ที่ใกล้เคียงบ่อยชนอีกคนหนึ่งที่ยิ่งใหญ่ 'ผนัง' ของการติดต่อระยะสั้น bisects ภูมิทัศน์ ที่ราบสแควร์มาปิดตรงเส้นทแยงมุมกับโดเมนจีโนมข้นเรียกว่าโดเมนที่ติดต่อ ยอดเขาในภูมิทัศน์ที่สอดคล้องกับลูปในจีโนม โดเมนติดต่อเขตแดนมักจะลูปซึ่งเป็นเหตุผลที่โดเมนตารางมักมียอดเขาในมุมของพวกเขา

ตัวควบคุมจะบินไปในทิศทางใดก็ตามที่คุณมองหา มองตรงขึ้นสำหรับกระโดดซุปเปอร์

Juicebox VR ถูกสร้างขึ้นโดยมูฮัมหมัด Shamim, สั่นสะท้าน Machol และ Erez ไอลีเบอร์แมน

ข้อมูลที่ถูกดึงมาจาก:

Suhas ราว * เรียม Huntley *, เนวา C. Durand, Elena Stamenova อีวาน Bochkov จิมโรบินสัน, เอเดรีย Sanborn, สั่นสะท้าน Machol, Arina Omer เอริค Lander และ Erez ไอลีเบอร์แมน 3D แผนที่ของจีโนมมนุษย์ที่ Kilobase มติเผยหลักการ Chromatin Looping, เซลล์ (2014)

* ส่วนร่วมอย่างเท่าเทียมกัน

โปรดทราบว่าข้อมูลที่ใช้ในการสร้างภูมิทัศน์ที่เป็นพื้นที่ขนาดเล็กมากจากเต็มรูปแบบแผนที่จีโนมทั้ง แผนที่การติดต่อแบบเต็มสำหรับจีโนมมนุษย์เป็นล้านล้านครั้งใหญ่กว่าแผนที่นี้

เรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับการทำงานของเราได้ที่ www.aidenlab.org

เพลง: ขึ้นโดย Stellardrone

สิ่งสำคัญ: ให้ถูกต้องดู app ที่ชุดหูฟังเสมือนจริงเช่น Google กระดาษแข็ง, Durovis ดำน้ำหรือ Samsung เกียร์ VR ควรใช้