Juicebox VR

Explore data penjujukan genom Hi-C 3D dalam persekitaran realiti maya!

Juicebox VR mewujudkan perwakilan realiti maya data yang dihasilkan oleh kaedah Hi-C bagi tiga dimensi penjujukan genom. Setiap kedudukan 2D dalam landskap sepadan dengan sepasang jawatan 1D, atau lokus, dalam genom manusia tiga-bilion-surat panjang. Ketinggian di kedudukan 2D yang mewakili berapa kerap dua lokus adalah bersentuhan dalam nukleus sel.

Sejak lokus berdekatan kerap bertemu satu sama lain, yang 'dinding' besar hubungan jarak dekat membahagi dua sama landskap. Dataran tinggi Square datang dari pepenjuru sesuai untuk domain genomik pekat, domain kenalan dipanggil. Peaks dalam landskap yang sesuai dengan gelung dalam genom. Domain Hubungi sering ditandakan oleh gelung, yang adalah mengapa domain persegi sering mempunyai puncak di sudut mereka.

Pengawal ini akan terbang di mana arah anda melihat. Lihatlah lurus untuk melompat super.

Juicebox VR telah dicipta oleh Muhammad Shamim, Ido Machol, dan Erez Lieberman Aiden.

Data yang diambil dari:

Suhas Rao *, Miriam Huntley *, Neva C. Durand, Elena Stamenova, Ivan Bochkov, Jim Robinson, Adrian Sanborn, Ido Machol, Arina Omer, Eric Lander dan Erez Lieberman Aiden. A Peta 3D Genom Manusia di Kilobase Resolusi Mendedahkan Prinsip kromatin Menggelung, Sel (2014).

* Menyumbang sama

Ambil perhatian bahawa data yang digunakan untuk menghasilkan landskap adalah rantau yang sangat kecil dari penuh, peta genom-lebar. Peta kenalan penuh untuk genom manusia adalah satu trilion kali lebih besar daripada peta ini.

Ketahui lebih lanjut mengenai kerja kami di www.aidenlab.org.

Muzik: Ascent oleh Stellardrone

PENTING: Untuk betul melihat aplikasi, alat dengar Realiti Maya, seperti Google kadbod, Durovis Dive, atau Samsung Gear VR harus digunakan.